WPARとコンテナの違いは？

要するに

WPARはAIXで利用されるコンテナ技術

です。

コンテナの意味にもよりますが、プロセスを他のプロセスと切り離すという点ではコンテナと同じです。ただし、一般的にコンテナ＝Docker＝Linuxというイメージもあります。